Argentina: Se detectan variantes de preocupación del SARS-CoV-2 sin nexo epidemiológico ni contacto estrecho con viajeros
Son cuatro las variantes de relevancia epidemiológica que se detectaron en territorio argentino, que corresponderían a casos de infecciones adquiridas en la comunidad o de origen desconocido: la variante 501Y.V1 (Reino Unido), la variante 501Y.V3 (Manaus), la variante P.2 (Rio de Janeiro) y la variante CAL.20C (linaje B.1.427, California).
Lo afirma el último reporte que presentó el Consorcio Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2 (Proyecto PAIS) –creado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación– sobre 297 muestras de personas infectadas por SARS-CoV-2 residentes en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires (CABA) y la provincia de Buenos Aires, sin antecedentes de viaje al exterior, y de 16 muestras de residentes en Córdoba, relacionados con reingreso de turistas argentinos, contactos estrechos o casos adquiridos en la comunidad. Todas las muestras fueron obtenidas entre el 1 de febrero y el 15 de marzo de 2021. Algunos de los casos detectados de las variantes 501Y.V1 (Reino Unido), 501Y.V3 (Manaus) y CAL.20C (California) corresponden a individuos sin antecedentes de viaje ni contacto estrecho con viajeros. Hasta el momento, no se detectó la combinación de mutaciones característica de la variante 501Y.V2 (Sudáfrica)
Detección de la variante 501Y.V1 (Reino Unido)
La combinación de mutaciones característica de la variante 501Y.V1 (Reino Unido) se de-tectó en 16 casos (13 de CABA y 3 del Gran Buenos Aires –GBA– oeste), tres de ellos corres-ponden a contactos estrechos de los casos reportados, mientras que los otros diez corres-ponderían a casos de adquisición en la comunidad. En la provincia de Córdoba se detectaron seis casos de la variante 501Y.V1 (Reino Unido), de los cuales cuatro presentan antece-dente de viaje y dos son contactos estrechos de estos.
Es importante destacar que se observó un aumento en la frecuencia de detección de la variante 501Y.V1 (Reino Unido) en el Área Metropolitana de Buenos Aires (AMBA) durante las últimas semanas epidemiológicas.
Detección de la variante 501Y.V3 (Manaus)
La combinación de mutaciones características de la variante 501Y.V3 (P.1, Manaus) se de-tectó en tres casos de CABA, dos de los casos presentan nexo epidemiológico entre sí (con-tacto estrecho). Ningún caso tiene antecedente de viaje al exterior ni contacto estrecho con viajero, por lo que corresponderían a casos de origen desconocido. En Córdoba se de-tectaron seis casos de la variante 501Y.V3 (P.1, Manaus), de los cuales uno presentó antece-dente de viaje y los cinco restantes son contactos estrechos de este.
Detección de la variante P.2 (Rio de Janeiro)
En 35 casos se confirmó la identificación de la variante P.2 (Rio de Janeiro) por secuenciación de genoma completo y análisis filogenético. De ellos, solo uno tenía antecedente de viaje, y el resto corresponden a casos de circulación comunitaria.
Detección de las mutaciones S_L452R/Q y de la variante CAL.20C
En dos de estos casos, se identificó la variante CAL.20C (linaje B.1.427, California) a partir de la secuenciación del genoma completo, uno de ellos de CABA. En otros 36 casos se de-tectaron mutaciones S_L452R/Q, los cuales continúan bajo análisis.
La vigilancia activa de estas variantes fue realizada por el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2, a través de los nodos de secuenciación del Laboratorio de Virología del Hospital General de Niños ‘Dr. Ricardo Gutiérrez’ (CABA), del Laboratorio de la Unidad de Genómica y Bioinformática del Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (UGB-INTA) de Castelar, y el Laboratorio Central de la Ciudad de Córdoba.
Es importante destacar que en caso que haya un aumento en la frecuencia de detección de la variante 501Y.V1 (Reino Unido) en las próximas semanas podría tornarse la variante dominante de las nuevas infecciones como sucedió en países de Europa y Estados Unidos.
Es sumamente relevante reforzar las medidas sanitarias de prevención de nuevos casos (dis-tanciamiento físico, ventilación de ambientes, lavado frecuente de manos, uso de barbijo) hasta la disponibilidad de vacunas para toda la población en mayor riesgo de padecer enfer-medad severa por SARS-CoV-2.
Características biológicas de las variantes y mutaciones relevantes
Variante 501Y.V1 (Reino Unido): Ha sido asociada a una mayor tasa de transmisión (30-90%) que las variantes que han circulado previamente. A su vez, esta variante ha sido asociada con un mayor riesgo de hospitalizaciones y muerte.
Variante 501Y.V3 o P.1 (Manaus): Ha sido asociada a una mayor tasa de transmisión y rápi-da propagación, respecto de variantes de la primera ola.
Mutación E484K en la proteína Spike: Se encuentra presente en las variantes P.1 (Manaus) y 501Y.V2 (Sudáfrica) (en combinación con otras mutaciones relevantes en Spike) y también en la variante P.2 (Rio de Janeiro). Además, resulta una mutación emergente de muy reciente aparición en otras variantes como en la variante 501Y.V1 (Reino Unido) que fue denominada “cluster B.1.1.7 con E484K”, entre otras. Se asoció con resistencia a la neutrali-zación por anticuerpos monoclonales, sueros de convalecientes y de vacunados.
Mutación L452R/Q/M en la proteína Spike y variante CAL.20C (linajes B.1.427/B.1.429, Ca-lifornia): Los linajes B.1.427 y B.1.429 emergieron en mayo del 2020, pero aumentaron su frecuencia de 0% a más de 50% entre septiembre de 2020 y fines de enero de 2021, con una transmisibilidad levemente aumentada respecto de otros SARS-CoV-2 circulantes. Estos resultados de un aparente mayor nivel de transmisión, sumado a un impacto significativo en la neutralización de anticuerpos monoclonales aprobados para el tratamiento de la CO-VID-19, y una moderada reducción de la neutralización mediada por sueros de convalecientes o de inmunizados por vacunas impulsaron a los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de Estados Unidos a clasificar estas variantes como de preocupación (variants of concern, VOC).
Fuente: REC
